Plusieurs fonctionnalités s’ajoutent à la Wii U, parmi lesquelles nous trouvons le transfert de données et de logiciels d’une Wii U à une autre ce qui implique le formatage automatique de la première et l’écrasement des données cibles de la seconde. Cela a été rendu possible grâce au Patch 5.1.0E. Au japon, la console de salon peut effectuer un bon nombre de tâches qui n’existent pas ailleurs dans le monde. Parmi lesquels nous trouvons le Scanner NFC qui permet d’effectuer des paiements sans contact à l’aide de cartes NFC prépayées. Il est aussi possible de naviguer dans le Nintendo e-Shop avec la télécommande Wii, la Wii U pro Controller ou la manette classique.